Évaluation de l’utilité de la culture virale du liquide céphalo-rachidien

Les tests d’amplification des acides nucléiques sont la méthode préférée pour détecter les entérovirus et les Herpesviridae dans le liquide céphalo-rachidien, mais les cliniciens demandent toujours la culture virale. Des cultures virales d’échantillons de liquide céphalo-rachidien ont trouvé que les espèces non-herpesviridae test d’amplification de l’acide est réalisée, la culture virale peut avoir aucun avantage supplémentaire

les échantillons ont donné des résultats positifs dans l’ensemble, avec% des échantillons ayant des résultats positifs pour les deux méthodes,% ayant des résultats de culture positifs seulement, et% ayant des résultats de PCR positifs seulement. échantillons dont la culture et la PCR HSV ont été réalisées Parmi ces échantillons, les échantillons étaient positifs au VHS et le VHS n’a été détecté que pour tous les% par PCR. Le temps moyen nécessaire pour obtenir un résultat de culture complet positif était hn =, une période de temps plus long que le temps moyen nécessaire pour obtenir un résultat positif de EV PCR h; n = De même, le temps moyen nécessaire pour obtenir un résultat de culture achevé positif pour HSV était h n =, une période plus longue que le temps moyen nécessaire pour obtenir un résultat PCR positif pour HSV h; n = La durée moyenne requise pour obtenir un résultat négatif par culture était h n = ,, une période qui était plus longue que celle nécessaire pour obtenir un résultat PCR négatif pour EV h; n =, ou HSV h; Au cours des dernières années, notre laboratoire a reçu des demandes de culture virale à partir d’échantillons de liquide céphalorachidien, en provenance et à la demande, ce qui a entraîné une dépense annuelle moyenne de $, par année pour la santé. Discussion Les méthodes basées sur l’amplification de l’acide nucléique ont émergé comme norme reconnue pour la détection des EV et des Herpesviridae dans les échantillons de LCR et sont de plus en plus demandées dans le cadre du diagnostic. Cependant, les cliniciens demandent encore couramment la culture virale d’échantillons de LCR au lieu ou en complément de TAAN. Une explication possible de cette pratique est que les médecins s’attendent à ce que la culture virale puisse recouvrer des virus en plus de la tuberculose virale. EV ou Herpesviridae Notre examen annuel des cultures virales à partir d’échantillons de LCR a révélé que% de cultures positives ont récupéré soit EV soit HSV. des cultures positives% virus isolés cytomegalovirus, varicelle virus zona et adénovirus que NAAT, si elle était réalisée, aurait détecté plus rapidement et avec une plus grande sensibilité [,,,] Bien que nous n’ayons pas pu obtenir d’antécédents cliniques pour les virus Nous soupçonnons que les présentations cliniques ou les conditions prédisposantes de ces patients, par exemple, les nouveau-nés infectés congénitalement, les receveurs de greffe de cellules souches hématopoïétiques ou solides, les patients atteints de lymphome et les patients atteints de Il est clair que le NAAT reste plus cher que la culture, par exemple, les frais approximatifs sont $ pour la PCR EV, $ pour la PCR HSV, et $ pour la culture virale, mais avec sa sensibilité supérieure et sa rapidité résultats, NAAT génère des résultats plus significatifs avec un impact potentiellement plus important sur les soins aux patients Dans ce le rendement de la culture virale peut avoir été réduit par le retard du transport des spécimens vers un laboratoire de référence et pourrait être meilleur dans les laboratoires ayant la possibilité d’inoculer des spécimens frais. Les études qui ont spécifiquement examiné cette question suggèrent est généralement suffisant jusqu’à h après la collecte lorsque l’échantillon est transporté dans un milieu approprié , bien qu’une mauvaise récupération du VHS à des titres faibles puisse constituer une exception pertinente soulignant davantage la valeur de la PCR Nous reconnaissons également que des circonstances cliniques peuvent survenir Par exemple, lorsque des causes rares mais cultivables de méningo-encéphalite virale, comme la grippe, la parainfluenza, la rougeole et les oreillons, sont soupçonnées cliniquement pour lesquelles le TAAN n’est pas disponible, la culture virale peut servir de test d’appoint utile En fait, les oreillons, une cause fréquente de méningite et d’encéphalite à l’ère des prévaccines, ont récemment refait surface à plusieurs reprises. Cependant, il convient de souligner que les tests sérologiques et le TAAN sont devenus la norme diagnostique pour la majorité des causes virales reconnues de méningite et d’encéphalite pour lesquelles le diagnostic par des méthodes basées sur la culture est soit pas toujours possible, par exemple, arbovirus ou non indiqué en raison de la faible sensibilité, par exemple, HSV [,,,] Bien que limité aux expériences de laboratoire, nous démontrons les coûts potentiels encourus de la performance de routine de ces cultures et, surtout, corroborons les résultats précédents www.montfordpharmacy.com. d’autres que la culture virale pour EV et HSV est à la fois insensible et associée à un retard diagnostique marqué Nous concluons que la soumission régulière d’échantillons de CSF pour la culture virale spécifiquement pour récupérer les virus non détectés par NAAT est coûteuse et apporte un bénéfice supplémentaire minime. Nous recommandons que la culture virale des échantillons de LCR soit éliminée comme une pratique de laboratoire de routine

Remerciements

Nous remercions Erick Billetdeaux pour son aide dans l’extraction de données pour ce projet, et nous remercions le personnel de virologie pour son service et son dévouement Conflits d’intérêts potentiels CRP et CAP: pas de conflits