Commentaire éditorial: Diagnostic moléculaire de la pneumonie infantile: haut rendement, spécificité incertaine

L’utilisation de cultures bactériennes a montré que Streptococcus pneumoniae et Hib étaient les causes les plus fréquentes de pneumonie bactérienne . Ces données ont éclairé la prise en charge appropriée, c’est-à-dire le choix des antibiotiques de première ligne et les futures stratégies de vaccination. La culture de l’aspiration pulmonaire dans le contexte de la recherche était qu’elle fournissait un rendement beaucoup plus élevé que l’hémoculture et une plus grande certitude que les bactéries isolées du poumon étaient effectivement la cause de la pneumonie comparativement aux bactéries isolées du sang ou du rhinopharynx. [Dans ce numéro de Clinical Infectious Diseases, Howie et ses collègues rapportent de nouvelles découvertes de l’utilisation de techniques moléculaires sur des échantillons d’aspiration pulmonaire d’enfants atteints de pneumonie grave en Gambie pour détecter pathogènes potentiels Au moment de l’étude -, il y avait Le vaccin conjugué anti-Hib est précoce mais reste peu couvert par le vaccin antipneumococcique conjugué. Il s’agit d’un petit groupe d’enfants et, comme pour toutes les études d’aspiration pulmonaire, il existe un biais potentiel de sélection. Dans cette étude, les sujets sélectionnés pour l’aspiration pulmonaire représentaient% de toutes les pneumonies sévères cliniques chez les jeunes enfants pendant la période d’étude et% de ceux atteints de pneumonie grave et radiologique. consolidation Néanmoins, le rendement était très élevé en utilisant des techniques moléculaires avec des pathogènes potentiels identifiés en% des cas, comparé à un rendement en% en culture bactérienne. Les bactéries les plus fréquemment identifiées étaient S pneumoniae, détectées dans au moins un échantillon en% des cas. la majorité des isolats pneumococciques étaient des sérotypes inclus dans le vaccin -valent A f Une autre constatation intéressante est que% des cas ont eu & gt; Une étude antérieure sur l’aspiration pulmonaire d’enfants malawiens avec des critères de sélection similaires et un biais potentiel a également montré que les techniques moléculaires amélioraient considérablement le rendement par rapport à la culture. Cette étude a été réalisée avant la mise en œuvre du vaccin antipneumococcique conjugué au Malawi. L’étude malawienne n’a pas cherché à identifier une aussi large gamme de bactéries que cette étude récente de Gambie Hib était la deuxième bactérie la plus commune, identifiée chez les enfants, dont les personnes étaient infectées par le VIH et qui n’étaient pas complètement infectées. Le seul enfant infecté par le Hib identifié dans l’étude gambienne était également infecté par le VIH. La plus faible efficacité de la vaccination anti-Hib chez les enfants infectés par le VIH comparée aux enfants non infectés par le VIH a déjà été observée chez les enfants sud-africains. en utilisant des techniques de diagnostic moléculaire par rapport à cu lture; Cependant, il existe des limites potentielles à l’interprétation de ces données par des études d’aspiration pulmonaire. La principale est qu’on ne peut pas supposer que les bactéries détectées sont la cause de la pneumonie. Il est probable que la causalité peut être déduite avec plus de précision. échantillons par rapport aux échantillons du sang ou des voies respiratoires supérieures, des problèmes d’interprétation subsistent, y compris quand il y a & gt; Un autre avantage de la culture par rapport aux techniques moléculaires est qu’elle peut également fournir des données in vitro sur la sensibilité aux antibiotiques fièvre. De plus, les études d’aspiration pulmonaire peuvent sous-estimer le rôle de pathogènes potentiels tels que Mycobacterium tuberculosis en raison de la nécessité de limiter l’aspiration pulmonaire périphérique. Les études étiologiques de surveillance et de pneumonie sont particulièrement importantes en cette période de couverture mondiale croissante du vaccin antipneumococcique conjugué. Ce vaccin a un énorme potentiel pour réduire le fardeau de la pneumonie bactérienne, mais les outils actuellement disponibles pour la surveillance comme l’hémoculture fournissent un très faible Rendement du Pneumocoque Bien que l’aspiration pulmonaire soit plus sensible que le sang des enfants ayant subi une consolidation radiologique, il est peu probable que cette procédure soit largement utilisée pour la surveillance. Compte tenu du poids élevé de la méningite pneumococcique dans ces mêmes populations et du rendement élevé Dans ces cas, il s’agit d’un outil supplémentaire important pour la surveillance . La recherche de diagnostics très précis pour déterminer l’étiologie de la pneumonie et de la septicémie invasive dans les zones à forte mortalité se poursuit . gestion clinique Les diagnostics rapides ont le potentiel d’améliorer considérablement l’utilisation appropriée des antibiotiques chez les enfants et les adultes atteints de pneumonie et de septicémie invasive à l’échelle mondiale, y compris dans les milieux riches en ressources

Remarque

Conflits d’intérêts potentiels L’auteur ne certifie aucun conflit d’intérêts potentiel L’auteur a soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflit d’intérêts que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués