Épidémiologie de la pneumonie sévère causée par Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae: -Année, surveillance basée sur la population pour la pneumonie sévère en Thaïlande

ContexteLes espèces de Legionella, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae sont reconnues comme des causes importantes de pneumonie dans les pays à revenu élevé, mais leur importance dans les pays à revenu intermédiaire, comme la Thaïlande, est inconnue. Méthodologie Surveillance des patients hospitalisés détectés dans une pneumonie cliniquement définie province thaïlandaise rurale pour l’année Les patients ayant eu une radiographie thoracique pour des cas de pneumonie ont été inclus dans une étude d’étiologie incluant des cas de pneumonie chez des patients échantillons sériques, nasopharyngés et urinaires par paires pour des tests immunologiques et moléculaires de diagnostic. les années n’ont pas été systématiquement testées pour les espèces de Legionella Nous rapportons une incidence inférieure d’incidence observée et une limite supérieure extrapolée aux personnes non testées ou non incluses dans l’étudeRésultatsL’incidence de la pneumonie due à Legionella longbeachae nécessitant une hospitalisation était – cas par On a observé une pneumonie à Legionella pneumophila. L’incidence définie de la pneumonie à C. pneumoniae était – cas par population; les taux étaient les plus élevés chez les patients âgés de & lt; année – cas par, population et ceux âgés de ⩾ ans – cas par population M pneumoniae pneumonie avait une répartition par âge similaire, avec une incidence globale de – cas par population Ces pathogènes étaient associés à% de tous les cas de pneumonie Une proportion non significativement plus élevée de patients atteints de pneumonie associée à L longbeachae, comparé aux patients atteints de pneumonie associée à M pneumoniae ou C pneumoniae, a nécessité une ventilation supplémentaire d’oxygène ou mécanique% vs%; P & lt; Parmi les patients atteints de pneumonie atypique, seuls% ont reçu des antibiotiques avec une activité contre l’agent pathogène associé. Conclusion: pneumonie, C pneumoniae et L longbeachae, mais pas pneumophila, sont fréquemment associés à une pneumonie sévère en zone rurale. Peu de patients reçoivent des antibiotiques couvrant des agents pathogènes atypiques

La pneumonie reste une des principales causes de décès dans le monde, en particulier chez les enfants et les personnes âgées L’Organisation mondiale de la santé estime que les infections des voies respiratoires inférieures causent près de millions de décès par an, un taux de & gt; décès par, population Parmi les enfants âgés de & lt; Les estimations précises de l’incidence des étiologies spécifiques de la pneumonie sont précieuses pour l’allocation appropriée des ressources de santé publique, l’établissement des priorités vaccinales, et le développement de normes fondées sur des preuves pour le traitement. Les probabilités de pathogènes varient d’une population à l’autre, des données régionales sont nécessaires, en particulier dans les pays en développement, les recommandations pour l’antibiothérapie empirique sont basées sur les fréquences relatives des agents pathogènes individuels, ainsi que sur la gravité de la maladie, les schémas de résistance et les comorbidités. Les pays à revenu intermédiaire et à faible revenu, où le fardeau de la pneumonie est élevé et les tests diagnostiques peuvent être moins facilement disponibles Les données d’incidence sont également importantes pour établir le niveau de référence du fardeau des maladies respiratoires – une première étape nécessaire pour détecter les écarts par rapport à la référence. sont attribuables à une maladie émergente Cette étude fournit certaines des premières estimations basées sur la population de l’incidence de la pneumonie sévère due aux pathogènes respiratoires atypiques. Espèces de Legionella, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae en Asie du Sud-Est Bien que ces pathogènes soient de plus en plus reconnus comme causes importantes de pneumonie. Pour estimer l’incidence de la maladie, nous avons effectué une surveillance active des populations de pneumonie adulte et pédiatrique hospitalisée à Sa Kaeo, une province rurale de Thaïlande, et effectué des tests de diagnostic immunologique et moléculaire pour patients inscrits sur une période d’un an

Méthodes

Les patients qui ont été réadmis à l’hôpital ⩾ jours après le congé de l’hôpital ont été classés comme ayant une pneumonie récidivante. La surveillance de population active a débuté en septembre et se poursuit dans tous les hôpitaux de Sa Kaeo. les hôpitaux de district, les grands hôpitaux provinciaux et les hôpitaux militaires Les patients hospitalisés recevant un diagnostic de pneumonie sont identifiés par un examen quotidien des dossiers d’admission, et un formulaire normalisé est rempli pour ceux qui répondent à la définition de cas de pneumonie clinique grave. une enquête a confirmé que% des résidents de Sa Kaeo présentant des symptômes de pneumonie étaient hospitalisés; De septembre à août, des patients atteints de pneumonie clinique sévère avec radiographie thoracique pratiquée à la discrétion du médecin traitant ont été invités à participer à une étude d’étiologie. Après un consentement éclairé, les infirmières ont prélevé des échantillons sériques, nasopharyngés et urinaires de patients hospitalisés après l’hospitalisation. Des échantillons de sérum convalescent ont été recueillis quelques semaines plus tard. Cette étude a été approuvée par le comité d’éthique du ministère thaïlandais de la Santé et le Méthodes de laboratoireLes anticorps IgG et IgM M pneumoniae ont été dosés à l’aide du système de test d’anticorps IgM / IgM M pneumoniae. Les titres IgG et IgM de Remel C pneumoniae ont été mesurés à l’aide d’un test de microimmunofluorescence Focus Diagnostics, conformément aux recommandations actuelles. Les tests PCR ont été utilisés pour Les titres combinés IgG, IgA et IgM de Legionella longbeachae ont été mesurés à l’aide d’un test d’immunofluorescence indirecte L’antigène pour l’immunofluorescence indirecte a été préparé en cultivant le sérogroupe L longbeachae, la souche Long Beach, sur des géloses d’extrait de levure de charbon de bois tamponné à ° C avec% CO pour h Legionella pneumophila sérogroupe niveau d’antigène urinaire a été mesurée par EIA Binax Les échantillons ont également été testés pour Streptococcus pneumoniae par test d’antigène urinaire chez des patients âgés de ⩾ ans, Coxiella burnetii par test sérologique , bacilles acidorésistants par frottis d’expectoration, virus grippal par culture, RT-PCR, et tests sérologiques, virus syncitial respiratoire par culture, RT-PCR et tests sérologiques, picornavirus par RT-PCR et tests sérologiques, adénovirus par culture, RT -PCR, et tests sérologiques, virus parainfluenza humains par culture, RT-PCR et tests sérologiques, et métapneumovirus humain par RT-PCR et s test étiologiqueDiagnostic étiologique La séroconversion aiguë a été définie comme une séroconversion pour anticorps IgG / IgM M pneumoniae négatifs à IgG / IgM positifs, une augmentation d’un facteur antibody du titre d’anticorps IgG ou IgM C pneumoniae, ou une augmentation d’un facteur to du titre d’anticorps à L titrage IgG / IgA / IgM longbeachae, ⩾: dans les échantillons de sérum appariés en phase aiguë et en phase de convalescence; un résultat de PCR de prélèvements naso-pharyngiens positifs pour C pneumoniae ou M pneumoniae; ou résultat d’un test d’antigène urinaire positif pour L pneumophila Une infection aiguë possible avec C pneumoniae a été définie comme un seul titre d’IgM ⩾: lorsque des échantillons sériques appariés n’étaient pas disponibles, un résultat PCR négatif a défini l’absence d’infection. la légionellose chez les enfants et les adolescents est rare , le dépistage de L longbeachae chez les patients âgés de & lt; années pour lesquelles un échantillon de sérum apparié était disponible pour confirmer l’absence de légionellose dans ce groupe d’âge, et aucun patient de ce groupe d’âge n’a été testé pour L pneumophila Aucune tentative n’a été faite pour attribuer une étiologie primaire lorsque plusieurs pathogènes Des méthodes statistiques Pour calculer la limite inférieure d’incidence de la pneumonie clinique sévère due à un agent pathogène spécifique, nous avons divisé le nombre de cas observés par des preuves de laboratoire d’une infection spécifique par des données provinciales de recensement Pour extrapoler la limite supérieure d’incidence, nous avons d’abord patients testés, la proportion de patients avec des résultats positifs pour chaque agent pathogène par strate d’âge et appliqué ces proportions à la population entière de patients atteints de pneumonie clinique sévère qui a été capturée par surveillance Ensuite, parce que% des résidents de la zone de surveillance ne cherchent pas soins hospitaliers pour une pneumonie , nous nous sommes ajustés pour l’accès aux soins selon l’âge De la limite inférieure à la limite supérieure La prévalence de la pneumonie clinique sévère spécifique au pathogène est la proportion de patients testés positifs pour chaque agent pathogène parmi tous les patients testés. Une moyenne mobile de mois a été utilisée pour calculer l’incidence mensuelle, sauf pour le premier et dernières observations, où une moyenne de -mois a été utilisée Le test de χ ou le test exact de Fisher ont été utilisés pour comparer les proportions

Résultats

Population étudiéeDe septembre à août, la surveillance active a identifié des cas de pneumonie clinique sévère; une radiographie thoracique a été réalisée pour% de ces cas Parmi les cas pour lesquels une radiographie thoracique a été réalisée,% des cas ont été inclus dans l’étude, y compris les cas récurrents Parmi ces cas inclus,% étaient chez les patients masculins,% étaient chez les patientes, chez les patients adultes d’âge, & gt; l’âge médian était les années premier et troisième quartiles, – années pour les adultes et les années premier et troisième quartiles, – années pour les enfants et les adolescents Six cas sont survenus chez les nouveau-nés, & lt; mois Comparé aux patients inscrits, parmi les non-inscrits, la proportion de cas chez les patients masculins était significativement plus faible% vs%; P & lt; , par χ test, et la proportion de cas chez les patients pédiatriques et adolescents était significativement plus élevée% vs%; P & lt; , par χ test Résultats du testDans les cas de patients enrôlés avec une pneumonie clinique sévère, des échantillons de sérum appariés ont été obtenus avec une médiane de jours écartés et ont été testés pour les cas%; échantillons de prélèvements nasopharyngés pour les cas>% ont été testés par PCR Collectivement, les cas% étaient chez des patients présentant des signes d’infections aiguës dues à un pathogène ⩾ atypique Le tableau montre la distribution des résultats des tests pour chaque agent pathogène atypique

Tableau View largeTélécharger les résultats des tests pour les cas d’infection aiguë à Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae et / ou Chlamydia pneumoniae chez les patients hospitalisés atteints de pneumonie cliniquement définieTable View largeTéléchargement slideTest résultats pour les cas d’infection aiguë à Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae et / ou Chlamydia pneumoniae Parmi les patients hospitalisés présentant une pneumonie cliniquement définie, aucun cas de pneumonie clinique grave chez les patients de ⩾ ans était le seul groupe d’âge testé à la fois pour L pneumophila et L longbeachae, aucun chez des patients présentant une infection à L pneumophila, mais le% des cas étaient patients présentant des signes sérologiques d’infection aiguë L longbeachae Parmi les cas chez les patients âgés de & lt; Les pneumonies étaient détectées dans% des cas. Les diagnostics d’infection à M pneumoniae étaient basés sur la séroconversion seule pour les cas, les résultats de la PCR seuls pour les cas et les concordances Résultats pour les cas Onze% des cas concernaient des patients dont les résultats de PCR étaient positifs et qui présentaient des signes sérologiques d’infection persistante ou récente. Les sérums de phase aiguë et de phase convalescente étaient positifs pour les anticorps dirigés contre M pneumoniae. les patients qui avaient des résultats de PCR négatifs et qui avaient des échantillons de sérum appariés étaient disponibles, seulement% présentaient des patients présentant des signes d’infection passée ou récente persistante% vs%; P & lt; , selon le test exact de Fisher. Quatre-vingt pour cent des cas concernaient des patients présentant une infection aiguë ou possible à C. pneumoniae aiguë:% des cas étaient survenus chez des patients testés et recevant un diagnostic sur la base d’une augmentation du titre d’anticorps multipliée par;; Un autre cas était chez des patients ayant reçu un diagnostic sur la base d’un seul titre élevé d’IgM Seroreversion pour anticorps anti M pneumoniae, c’est-à-dire d’un anticorps positif à un anticorps négatif dans un sérum apparié les spécimens étaient rares survenant dans <% des cas, tout comme les diminutions du nombre d'anticorps dans le C pneumoniae% ou L longbeachae <%> Répartition par âge et par sexe La table montre les limites inférieures et supérieures d’incidence de pneumonie clinique sévère due à chaque type atypique. agent pathogène selon l’âge L’incidence de la pneumonie à L. longbeachae était la plus élevée chez les adultes âgés de moins de 18 ans. années et augmenté avec l’âge, atteignant une incidence minimale de cas par, population parmi les patients âgés de ⩾ années chiffre La proportion de cas dus à L longbeachae a varié de% à% parmi les patients âgés & gt; ans L’incidence de l’infection à L longbeachae était plus élevée chez les patients de sexe masculin dans toutes les strates d’âge, avec un rapport de taux global entre hommes et femmes RR de% IC, –

Tableau View largeTélécharger Diapositives inférieures et supérieures d’incidence de la pneumonie clinique associée à Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae et / ou Chlamydia pneumoniae, par groupe d’âgeTable View largeTélécharger diapo Limites inférieures et supérieures d’incidence de pneumonie clinique associées à Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae, et / ou Chlamydia pneumoniae, par groupe d’âge

Figure Vue largeTélécharger la diapositiveIncidence minimale de l’infection chez les adultes de Legionella longbeachae âgés de & gt; ans seulement, Mycoplasma pneumoniae, et Chlamydia pneumoniae, par âgeFigure View largeTélécharger slideIncidence minimale de l’infection chez les adultes de Legionella longbeachae âgés de & gt; années seulement, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae, selon l’âge

Figure vue grandDownload slideProportion de tous les cas de pneumonie associée à Legionella longbeachae adultes âgés & gt; années seulement, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae, par âge La proportion de cas d ‘infection à L longbeachae chez les patients âgés de – ans ne sont pas incluses dans la figure; % des patients testés dans ce groupe d’âge étaient positifs pour L longbeachaeFigure View largeTélécharger slideProportion de tous les cas de pneumonie associée à Legionella longbeachae adultes âgés & gt; années seulement, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae, par âge La proportion de cas d ‘infection à L longbeachae chez les patients âgés de – ans ne sont pas incluses dans la figure; % des patients testés dans ce groupe d’âge étaient positifs pour la pneumonie L longbeachaeFor M pneumoniae, l’incidence était la plus élevée chez les nourrissons d’âge, & lt; année, au cas par cas, population, et chez les patients âgés âge, ⩾ années, au cas par cas, chiffre de population M pneumoniae était également le pathogène atypique le plus fréquemment identifié chez les enfants et les adolescents, associé à près de% des cas de pneumonie pédiatrique chez les enfants enfants âgés de & lt; ans et presque% des cas de pneumonie chez les patients âgés de – ans Le RR chez les pneumonies M pneumoniae variait selon l’âge: chez les enfants et les adolescents, l’incidence était significativement plus élevée chez les garçons que chez les filles RR; % CI, -; chez les adultes, l’incidence était plus élevée chez les femmes que chez les hommes RR; % IC, – L’incidence globale de la pneumonie à pneumonie C définie était de – cas par population Lorsque les cas associés à une infection possible par C pneumoniae ont été ajoutés, l’incidence a augmenté de -gold; -fold Ce changement dépendait de l’âge, croissant chez les patients âgés de ⩽ ans , – parmi les patients âgés de – ans, et – parmi ceux âgés de ⩾ ans, sur la base des calculs d’incidence observés, l’infection à C. pneumoniae définie et possible était associée à% des cas de pneumonie chez les patients âgés de & gt; années et% de cas pédiatriques; cependant, lorsque seuls les cas associés à une infection définie ont été considérés, la prévalence des cas associés à ce pathogène était significativement plus faible, à% chez les adultes et% chez les enfants et les adolescents. femmes RR,; % IC, – et beaucoup plus élevé chez les garçons que chez les filles RR; % CI, -Temporal distributionFigure montre le nombre de cas de pneumonie clinique due à chaque agent pathogène, par mois, et inclut le nombre de cas de pneumonie confirmée par radiographie thoracique pour comparaison Le nombre de cas de pneumonie toutes causes confondus entre février et avril, et le nombre de cas de M pneumoniae, C pneumoniae et L longbeachae pneumonia a culminé entre Septembre et Décembre Pneumonie due à M pneumoniae et C pneumoniae était largement absent d’Avril à Juin La distribution temporelle des cas d’infection possible à C pneumoniae était similaire à celle des cas de données définitives d’infection à C pneumoniae non représenté

Figure Vue largeDownload slideNombre de cas de Legionella longbeachae, de Mycoplasma pneumoniae, de Chlamydia pneumoniae et de pneumonie toutes causes confondues, par mois, avec une moyenne mobile de 9 moisFigure View largeDownload slideNombre de cas de Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae et toutes causes confondues. pneumonie, par mois, avec une moyenne mobile par moisCoinfection et évolution cliniqueCoinfections étaient fréquentes parmi les cas de pneumonie associée à des infections définies et possibles table atypique Soixante-cinq pour cent des cas d’infection L longbeachae étaient chez les patients présentant des signes d’infection au moins pathogène, et% -% des cas d’infection à M pneumoniae ou C pneumoniae étaient également chez des patients co-infectés Le virus grippal était le copathogène le plus commun

Tableau View largeDownload slideCoinfections et résultats radiographiques pour les cas de pneumonie clinique associée à Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae, et / ou Chlamydia pneumoniaeTable View largeTélécharger slideCoinfections et résultats radiographiques pour les cas de pneumonie clinique associée à Legionella longbeachae, Mycoplasma pneumoniae, et / ou Chlamydia pneumoniaeNous avons observé Pendant l’hospitalisation, une proportion non significativement plus élevée de patients adultes infectés par L longbeachae nécessitait des procédures médicales indiquant une ventilation mécanique sévère ou un supplément d’oxygène, comparativement aux patients infectés par M pneumoniae ou C pneumoniae% vs%; P & lt; , par le test exact de Fisher Parmi tous les patients adultes infectés par au moins un pathogène bactérien atypique,% présentaient une maladie sous-jacente significative, y compris une maladie cardiaque, hépatique ou rénale; maladie pulmonaire obstructive chronique; asthme; Diabète; accident vasculaire cérébral; malignité; Parmi les patients infectés par un agent pathogène atypique, la majorité des patients ont reçu un antibiotique β-lactame seul ou en combinaison avec un autre antibiotique. Les aminoglycosides étaient les deuxièmes plus fréquemment prescrits chez les enfants et les adolescents. classe d’antibiotiques Seuls les patients% ont reçu des antibiotiques qui ont une activité contre les infections atypiques, par exemple, les macrolides ou les quinolones Parmi ces patients, étaient des adultes Seize patients%, dont des enfants, n’ont pas reçu de traitement antimicrobien

Discussion

Chez les enfants, nous avons constaté que l’incidence de la pneumonie à M pneumoniae et de la pneumonie à pneumonie C était la plus élevée chez les patients âgés de moins de 18 ans. En revanche, les premières études basées sur la population aux États-Unis et en Europe ont révélé que l’incidence de pneumonie M et C pneumoniae pneumonie pédiatrique était plus faible chez les patients âgés de ans – et plus élevé chez les patients âgés de ,] Cette différence d’incidence selon l’âge peut être liée aux différences entre les populations étudiées quant au moment et à la fréquence d’exposition des enfants aux autres enfants. Bien que l’incidence soit la plus élevée dans les groupes d’âge les plus jeunes, M pneumoniae et C pneumoniae La pneumonie pédiatrique sévère augmentait avec l’âge, soulignant l’importance continue de ces agents pathogènes dans ces groupes d’âge, comme cela a été précédemment rapporté À l’âge adulte, l’incidence de pneumonie à M pneumoniae et de pneumonie à pneumonie C est la plus élevée. l’incidence de la pneumonie à M pneumoniae est significativement plus élevée chez les femmes que chez les hommes – une constatation qui a Par rapport aux autres causes de pneumonie, la pneumonie chez l’adulte causée par M pneumoniae était plus rare dans la population de surveillance que ce qui a été rapporté dans les études de population sur les patients hospitalisés. pneumonie aux États-Unis et en Europe% -% , et la proportion de cas de pneumonie associée à une infection à C. pneumoniae définie était similaire à celle observée dans d’autres populations La présentation clinique et les résultats radiographiques sont de mauvais prédicteurs d’étiologie atypique [ Par conséquent, d’autres études ont révélé que le traitement initial de la pneumonie acquise dans la communauté nécessitant une hospitalisation avec des régimes qui couvrent des agents pathogènes atypiques, comme une quinolone seule ou un macrolide plus un antibiotique β-lactame, conduit à de meilleurs résultats , et aux lignes directrices thérapeutiques actuelles Ces résultats sont dus à peu de patients de notre étude. Nous n’avons pas été en mesure d’évaluer l’impact du type de traitement antimicrobien sur les résultats. Le diagnostic des infections atypiques reste problématique, et une grande partie de la variabilité de fréquence entre les études est probable en raison des différences dans les tests diagnostiques et les critères utilisés Nous avons utilisé des critères sérologiques recommandés et des techniques moléculaires validées pour caractériser de façon conservatrice une infection confirmée Pour soutenir la conclusion que la séroconversion en anticorps contre M pneumoniae ou une ⩾ L longbeachae résulte d’une infection – et pas seulement de tests peu reproductibles – nous avons examiné le nombre de séroréversions et de diminutions comparables des taux d’anticorps et notons que de tels événements étaient une fréquence rassurante rare de sérorévions et des diminutions du titre d’anticorps,% de l’infection à C pneumoniae en particulier continue d’évoluer, bien que des efforts aient été faits pour promouvoir une approche diagnostique standard des tests de C pneumoniae Les points forts de notre étude comprennent la détermination presque complète des cas de pneumonie clinique sévère hospitalisée chez une population source bien définie, associée à des tests de diagnostic approfondis. , dans une région du monde où l’épidémiologie de la pneumonie est mal connue Notre étude comportait également certaines faiblesses. En plus des limites des tests diagnostiques, tous les patients présentant des signes et symptômes de pneumonie ne se sont pas présentés à l’hôpital. à l’hôpital, tous n’ont pas subi de radiographie thoracique; parmi tous ceux qui ont eu une radiographie thoracique, tous n’ont pas été inclus dans l’étude d’étiologie, et tous les sujets n’ont pas été appariés. De plus, comme la définition de pneumonie sévère repose sur des critères cliniques plutôt que radiographiques, sa spécificité peut être réduite. , nous avons été incapables de mesurer une incidence précise de pneumonie sévère et, au lieu, présenté une limite inférieure basée sur l’incidence observée parmi les patients inscrits et une limite supérieure basée sur une extrapolation Enfin, la province de Sa Kaeo peut ne pas être représentative de l’ensemble des En résumé, L longbeachae mais pas L pneumophila est fréquemment associé à une pneumonie adulte sévère dans certaines parties de la Thaïlande rurale, et C pneumoniae et M pneumoniae sont associés à la pneumonie adulte et pédiatrique. Peu de patients atteints de pneumonie reçoivent des antibiotiques qui ont une activité contre ces pathogènes. l’incidence de la pneumonie associée à des étiologies atypiques suggère que la thérapie initiale wi les antibiotiques qui couvrent les agents pathogènes atypiques produiraient des bénéfices similaires à ceux observés dans d’autres populations de patients, bien que des études de résultats locaux soient nécessaires, en plus des considérations de disponibilité et de coût

Remerciements

Soutien financierCentres pour le contrôle et la prévention des maladies Conflits d’intérêts potentielsTous les auteurs: pas de conflits