Étiologie de la gastro-entérite dans les pratiques générales sentinelles aux Pays-Bas

Les données d’une étude cas-témoin générale sur la gastro-entérite et les agents pathogènes associés à cette maladie ont été utilisées pour étudier l’association entre des agents pathogènes spécifiques et l’âge et les symptômes des patients infectés. stratifié par âge, est également présenté chez les enfants souffrant de gastro-entérite qui étaient & lt; ans, rotavirus chez% des patients et virus NLV de type Norwalk; en% étaient les pathogènes les plus communs Parmi les patients âgés de – ans, les espèces Campylobacter en% des patients et Giardia lamblia en% étaient les agents pathogènes les plus courants Chez les patients plus âgés, l’espèce Campylobacter était également le pathogène le plus commun% à% des patients En outre, plusieurs symptômes chez les patients étaient associés à des pathogènes spécifiques. Le sang dans les selles était associé à une infection par Campylobacter. Chez les patients atteints de fièvre, des espèces de Salmonella, des espèces Campylobacter et des rotavirus étaient détectés relativement souvent. la première étude aux Pays-Bas et l’une des premières études au monde à avoir étudié un large éventail de pathogènes prélevés sur une population non sélectionnée de patients ayant consulté des médecins généralistes en raison d’une gastro-entérite

Dans les pays industrialisés, la gastro-entérite infectieuse reste l’une des maladies les plus courantes Des données cliniques et épidémiologiques sur les différentes infections peuvent être analysées ensemble pour obtenir des informations sur les groupes de patients à risque et développer des outils pour aider les praticiens à diagnostiquer. Bien que les caractéristiques cliniques et épidémiologiques des patients ne permettent jamais de distinguer complètement les infections de pathogènes différents, elles peuvent être des indicateurs utiles. La plupart des études épidémiologiques, aux Pays-Bas et ailleurs, ont porté sur une population sélectionnée de patients praticiens généralistes ou spécialistes, ou ils se sont concentrés sur un pathogène spécifique dans les enquêtes sur les caractéristiques cliniques, les caractéristiques démographiques, et la saisonnalité liée à l’infection L’étiologie est restée peu claire dans la majorité des cas. prévalence relative o f la vaste gamme de pathogènes pouvant causer une gastro-entérite et les caractéristiques démographiques et cliniques liées à ces infections chez un groupe non sélectionné de patients souffrant de gastroentérite . Par conséquent, les données d’une étude cas-témoin sur la gastro-entérite ont été utilisées pour identifier les caractéristiques des patients infectés par un pathogène spécifique chez tous les patients atteints de gastro-entérite qui se sont présentés à un médecin généraliste. Les résultats microbiologiques de cette étude ont été étudiés en fonction de l’âge, du sexe, des caractéristiques cliniques, de la distribution régionale, et le degré d’urbanisation déterminé sur la base de la taille de la ville et de la densité de la population des patients

Patients et méthodes

y basé sur la teneur élevée en peptone pour la détection des espèces de Salmonella et Shigella en jours, et Pour la détection des espèces de Yersinia, le milieu CIN de Schiemann a été utilisé Oxoid CM; sélectivité basée sur la présence de désoxycholate, et les échantillons ont été incubés pendant plusieurs jours à ° C La détection des espèces de Campylobacter a été réalisée après incubation des échantillons pendant plusieurs jours à ° C dans un environnement micro-aérophilique avec utilisation de Campylobacter agar Oxoid sans sang CM ; sélectivité basée sur la présence de désoxycholate additionné de céfopérazone et d’amphotéricine B Oxoid SR Pour la détection d’autres sérotypes VTEC, g de l’échantillon frais de selles a été mis en suspension dans des mL de bouillon Trypton Soya Oxoid CM: milieu d’enrichissement additionné d’acriflavine mg / mL Après incubation pour h à ° C, les gènes eae qui codent la protéine de fixation et d’effacement E coli qui est impliquée dans l’invasion des microvillosités, SLTI, et / ou SLTII entérotoxines de type Shiga qui pourraient conduire à un syndrome hémolytique-urémique [HUS] par leur action sur les cellules endothéliales vasculaires ont été recherchées au moyen d’une PCR multiplex, comme décrit ailleurs avec des modifications mineures. Des échantillons ont été testés pour le rotavirus, l’adénovirus et l’astrovirus par ELISA Rotaclone et Adenoclone, Meridian Diagnostics; IDEIA pour la détection d’astrovirus, DAKO Diagnostics Pour la détection de NLV et SLV, l’ARN viral a été extrait des échantillons de selles après avoir été lié aux particules de silice et dosé par PCR transcriptase inverse Les parasites intestinaux ont été détectés au microscope examen des échantillons fixés au SAF Les différentes lames suivantes ont été examinées: un film humide d’iode coloré ou non coloré, pour détecter les trophozoïtes de protozoaires, de kystes et d’ovules helminthiques; une concentration d’iode de Ridley colorée, dans laquelle les kystes de protozoaires sont concentrés; une coloration modifiée de Ziehl-Neelsen de la concentration de Ridley, en particulier pour la détection des espèces de Cryptosporidium; et un frottis coloré à l’hématoxyline, coloré, pour détecter les trophozoïtes de protozoaires A × et un grossissement × ont été utilisés pour scanner la plupart des frottis, sauf pour les frottis permanents, qui ont été examinés en × Cette combinaison de techniques nous a permis de détecter les protozoaires G lamblia, E histolytica, Isospora belli, espèces de Cryptosporidium, Cyclospora cayetanensis, D fragilis, les œufs helminthiques, et les protozoaires non pathogènes B hominis, Entamoeba hartmanni, Entamoeba coli, Iodamoeba bütschlii, Chilomastix mesnili, Endolimax nana, et Trichomonas hominis Tous les lames ont été examinées par les mêmes techniciens bien formés Ces techniciens participent à un système externe de contrôle de la qualité réseau néerlandais, Stichting Kwaliteitsbewaking Medische Microbiologie; Système britannique d’évaluation externe de la qualité pour la microbiologie Le laboratoire dispose d’un certificat de contrôle qualité La sensibilité des techniques est différente pour les kystes protozoaires et les œufs d’helminthes La littérature indique que G lamblia est susceptible d’être identifié dans% -% des cas après microscopie examen de l’échantillon de selles Des protocoles standardisés ont été utilisés tout au long de l’étude Tous les échantillons de selles ont été conservés pour des investigations ultérieures en ° C, – ° C et – ° Analyses statistiques avec l’âge du patient, le sexe du patient, l’année d’étude Janvier-mars, avril-juin, juillet-septembre, octobre-décembre, région géographique, degré d’urbanisation et caractéristiques cliniques ont été étudiées chez des patients infectés par des pathogènes spécifiques et chez tous les patients chez lesquels un ⩾ des pathogènes a été détecté. limite arbitraire de ⩾ cas patients avec une infection spécifique a été choisi pour notre étude de l’association de l’infection avec des facteurs ot La régression logistique a été utilisée pour étudier les effets indépendants des variables en comparant les patients ayant une infection spécifique avec les patients ayant une gastro-entérite et n’ayant pas eu cette infection spécifique Sélection manuelle rétrospective sur la base des résultats du test du rapport de vraisemblance a été utilisé pour déterminer quelles variables ont contribué significativement au modèle La valeur AP de a été considérée comme statistiquement significative viagra générique. En outre, une variable a été conservée dans le modèle comme facteur de confusion si le OR des autres variables changeait de & gt;% Le facteur d’âge a toujours été conservé dans le modèle en raison de son fort potentiel de confusion pour tous les agents pathogènes. Pour chaque agent pathogène, des modèles de régression logistique ont été construits: modèle avec seulement les infections uniques avec ce pathogène excluant les infections mixtes. ont été observés, le modèle qui comprenait les infections mixtes a été choisi en raison de son highe r, même si le modèle ne comportant qu’une seule infection était, en théorie, l’espèce la plus saine incluse dans le modèle, espèce Salmonella, espèce Campylobacter, rotavirus et NLV. Sinon, le modèle des infections simples était présenté dans le modèle, G lamblia, D fragilis

Résultats

Au total, des échantillons de selles prélevés chez des patients et des patients témoins ont été examinés. Il n’y avait pas de différences significatives entre les patients et les patients témoins pour le quart de l’année de présentation, le sexe, la région géographique ou le degré d’urbanisation. Les patients étaient légèrement plus âgésAnalyse multivariée selon l’âge Le pourcentage d’échantillons de selles obtenus chez les patients cas et chez les patients témoins positifs pour les différents pathogènes, selon le groupe d’âge, est présenté dans le tableau montre les proportions relatives de patients infectés par les bactéries, virus, et parasites pour les différents groupes d’âge Globalement, ⩾ agent pathogène a été détecté en% des patients et% des patients témoins Parmi les patients, ce pourcentage a diminué avec l’âge, de% des patients du groupe d’âge le plus jeune Le pourcentage le plus élevé de patients témoins infectés par un agent pathogène a été observé chez e ans, principalement parce que la plupart des agents pathogènes décelés chez les témoins étaient des parasites. année, presque toutes les infections étaient virales, principalement des infections à rotavirus et NLV; figure et tableau Dans le petit groupe de patients témoins qui étaient & lt; Les SLV ont également été retrouvés chez un pourcentage élevé de patients du groupe d’âge témoin, mais seuls les patients du groupe témoin avaient été testés pour le SLV. Dans le cas des patients – ans, tous les pathogènes étaient fréquemment détectés, mais les agents pathogènes viraux, en particulier les rotavirus, étaient encore les plus communs chez les patients témoins dans ce groupe d’âge, différents pathogènes viraux et G lamblia ont été détectés.

Tableau View largeTélécharger la diapositive Le pourcentage de patients et de patients témoins qui ont été testés positifs pour différents microorganismes et le nombre d’échantillons de selles testés n, selon le groupe d’âge, y compris les patients présentant des infections mixtesTable View largeTéléchargement micro-organismes différents et nombre d’échantillons de selles testés n, selon le groupe d’âge, y compris les patients présentant des infections mixtes

Figure Vue large Diapositive de téléchargementLa proportion de cas de patients et de témoins contrôles dans différents groupes d’âge qui ont été infectés par des virus bactériens, viraux, à l’exclusion de Sapporo, ou des agents pathogènes parasitaires à l’exclusion de Dientamoeba fragilis ou présentant des infections mixtes. contrôle des patients témoins dans différents groupes d’âge qui étaient infectés par des virus bactériens ou viraux, à l’exclusion du virus apparenté à Sapporo, ou des agents pathogènes parasitaires à l’exclusion de Dientamoeba fragilis ou qui avaient des infections mixtes. Les patients étaient les pathogènes dominants, suivis par G lamblia In une proportion substantielle de patients témoins âgés de plusieurs années, G lamblia a été récupérée; Chez tous les patients âgés de ⩾ ans, les agents pathogènes dominants étaient les agents pathogènes, en particulier les espèces Campylobacter. Chez les patients témoins âgés de ⩾ ans, de faibles pourcentages d’agents pathogènes bactériens, viraux et parasitaires ont été trouvés. Parmi les patients âgés de ⩾ ans, le pourcentage de cas testés positifs pour les parasites était similaire à celui des patients témoins. Dans l’ensemble, aucun pathogène bactérien n’a été observé chez les patients témoins âgés de moins de ans. Parmi les patients du groupe d’âge & lt; Dans l’ensemble, le parasite éventuellement pathogène D fragilis et le parasite non pathogène B hominis étaient plus fréquents chez les patients témoins que chez les patients. les deux agents pathogènes étaient plus fréquents chez les patients âgés de plus de cinq ans que chez les patients témoins âgés de trois ans; Dans les groupes plus âgés, le contraire a été observé. La durée des symptômes était significativement associée au taux de détection de tous les agents pathogènes. Les espèces Campylobacter et Salmonella étaient toutes deux plus fréquentes chez les patients présentant des symptômes de & lt; semaine avant qu’ils consultent un GP Le rotavirus et le NLV étaient plus fréquents chez les patients qui présentaient des symptômes de & lt; jours avant la consultation, G lamblia était plus fréquente chez les patients ayant des symptômes de & gt; semaine avant la consultation, et D fragilis était plus fréquente chez les patients qui avaient des symptômes pour & gt; semaines avant la consultation Dans l’ensemble, un agent pathogène était le plus souvent détecté chez les patients qui présentaient des symptômes de & lt; semaine avant la consultation

Figure Vue largeDownload slidePourcentage de patients testés positifs pour divers pathogènes gauche axe Y et pour l’un des pathogènes droit axe Y, en relation avec la durée des symptômes jusqu’à la consultation NLV, virus semblable à NorwalkFigure View largeTélécharger la diapositivePourcentage de patients cas testés positif pour divers pathogènes gauche axe Y et pour tous les pathogènes droit axe Y, en relation avec la durée des symptômes jusqu’à la consultation NLV, Norwalk-like virusTable montre la distribution des variables liées à la personne et la maladie chez les patients qui étaient infecté par les différents agents pathogènes Les résultats des modèles de régression logistique multivariée pour chaque agent pathogène ne sont pas inclus dans le tableau mais sont décrits dans le texte.

Tableau View largeTélécharger la diapositiveCassez les patients qui ont été testés positifs pour les agents pathogènes, selon les variables associées à la maladie et aux caractéristiques du patientTable View largeTélécharger la diapositiveCassez les patients positifs pour les agents pathogènes selon les variables associées à la maladie et aux caractéristiques du patient les différentes années d’étude, avec le plus faible pourcentage de patients positifs pour le rotavirus trouvés dans la première année de l’étude / Après correction pour les autres variables, la RO pour la deuxième année était% CI, – et pour la troisième année était% CI, -, par rapport à celui de la première année Le trimestre de l’année était associé de manière indépendante à l’infection par le rotavirus, qui était plus fréquente au cours des premiers trimestres OU du deuxième trimestre, [% IC, -]; troisième quart, ; et quatrième trimestre, ; chaque OR est comparé à celui du premier trimestre; l’infection par des espèces de Campylobacter, plus fréquente au cours du deuxième trimestre, comparativement à celle du premier trimestre; % CI, -; et l’infection par des espèces de Salmonella, qui était plus fréquente au cours du troisième trimestre OU au cours du premier trimestre, ; deuxième quartier, ; troisième quart, ; et le quatrième trimestre, Le pourcentage de cas de fièvre positifs pour tous les agents pathogènes et pour les espèces de Salmonella, les espèces de Campylobacter et les rotavirus en particulier était significativement plus élevé que le pourcentage de cas de fièvre positifs pour les pathogènes susmentionnés. , avec les OR multivariés suivants: présence d’un agent pathogène,% CI, -; Espèces de Salmonella,% CI, -; Espèces de Campylobacter,% CI, -; et rotavirus,% IC, – Les espèces de Campylobacter ont été détectées significativement plus fréquemment. % IC, – et D fragilis ont été moins fréquemment observés. % CI, – dans le cas des patients avec du sang dans les selles qu’ils étaient dans le cas des patients sans sang dans les selles Dans le cas des patients avec des crampes abdominales, les espèces de Salmonella étaient significativement plus fréquentes; % IC, – et le rotavirus était significativement moins commun. % CI, – qu’ils ne l’étaient chez les patients sans crampes abdominales Les espèces Campylobacter étaient également plus fréquentes chez les patients présentant des crampes abdominales, mais pas significativement. Dans le cas des patients qui avaient des vomissements, le rotavirus et le NLV étaient plus fréquents: OR, [% CI , -]; NLV: Un agent pathogène a été détecté plus fréquemment chez les patients avec une fréquence maximale de ⩾ selles par jour OU; % CI, -, en particulier Campylobacter espèces OR,; % CI, -, que ce l’était dans le cas des patients avec une fréquence normale de selles par jour infections mixtes Dans le cas des patients%, & gt; pathogène à l’exclusion de D fragilis en tant qu’agent pathogène Chez les patients avec G lamblia, d’autres infections étaient présentes Yersinia, Salmonella [espèces], Campylobacter, rotavirus, adénovirus, E histolytica et infection à la fois par Salmonella et E histolytica En cas patients atteints de NLV, une infection supplémentaire était présente espèces de Campylobacter [cas], espèces de Salmonella [cas] et espèces de Cryptosporidium Il y avait d’autres infections mixtes, qui étaient dues aux espèces Cryptosporidium plus rotavirus, Cryptosporidium espèces plus E histolytica, espèces Salmonella plus espèces Campylobacter , Yersinia species plus VTEC, adenovirus plus VTEC, et Campylobacter species plus astrovirus Il n’y avait pas de différence dans la proportion de cas de patients infectés par D fragilis parmi ceux qui avaient des co-infections [%] et ceux qui n’avaient pas de co-infection [%] des infections à B hominis étaient plus fréquentes chez les patients non infectés par un autre pathogène n qu’ils ne l’étaient chez les patients infectés par un autre agent pathogène à l’exclusion de D fragilis; [%] de vs [%] de, respectivement; OU, ; % IC, – La co-infection avec B hominis et D fragilis était plus fréquente que ce que l’on pourrait attendre d’après leur apparition séparée dans le cas où les patients observaient un taux d’infection,% [/]; taux d’infection prévu,%; P = et chez les patients témoins observés,% [/]; attendu,%; P =

Discussion et conclusions

que D fragilis peut causer de la diarrhée chez les enfants Une étude a montré que D fragilis est pathogène chez les enfants mais n’a pas montré qu’il en était de même pour les adultes Groupe d’âge – ans Ce groupe comprend les jeunes adultes qui commencent leur propre ménage et les personnes qui voyagent , qui sont tous deux connus pour être des facteurs de risque d’infection à Campylobacter, l’agent pathogène le plus commun chez les personnes de ce groupe d’âge. La légère augmentation de la prévalence de l’infection par le rotavirus et le NLV Chez les patients âgés de plus d’un an, les patients âgés de un an et de G lamblia pourraient être dus au rôle de ces patients en tant que parents / soignants d’enfants dans les groupes d’âge à haut risque. Les résultats d’une étude réalisée au Royaume-Uni ont montré un pourcentage global similaire de patients ayant un test positif pour le pourcentage d’astrovirus, bien que la tendance à la positivité ait diminué avec le pourcentage d’astrovirus dans ce groupe d’âge. âge On pense que l’astrovirus infecte presque tous les enfants & lt; Les anticorps anti-sérotype étaient présents chez presque toutes les personnes de ⩾ ans qui ont été testées lors d’une sérosurveillance La séroprévalence des anticorps dirigés contre d’autres sérotypes était plus faible Etant donné la faible incidence des infections astrovirales dans cette étude, les astrovirus L’infection peut généralement être bénigne, ne pas nécessiter une visite chez le médecin et peut même être asymptomatique. Dans un proche avenir, nous analyserons les données d’une étude de cohorte communautaire et aborderons ce problème plus en profondeur. Les causes principales des éclosions de gastro-entérite chez les patients âgés Cependant, dans notre étude, le VNB n’était pas un pathogène commun chez les patients du groupe d’âge le plus âgé. Dans une étude au Royaume-Uni, le VLB était plus fréquemment ⩾ ans dans la population générale, mais pas parmi les patients consultant un médecin généraliste Il est possible que les membres du personnel des centres de soins assistés et de soins infirmiers aient suffisamment d’expérience en cas d’éclosion d’infection. En outre, bien que les patients du groupe d’âge le plus âgé ne soient pas sous-représentés dans notre étude, les personnes âgées vivant dans des établissements de soins assistés et de soins infirmiers ont pu être sous-représentées.Durée des symptômes Différences dans la détection des pathogènes entre les patients ayant des durées de symptômes différentes avant leur consultation avec un médecin généraliste reflètent la gravité de la maladie et la durée de l’épisode. Cependant, les différents taux pourraient également refléter des différences dans la possibilité de détecter les différents pathogènes à différents stades de la maladie. que les infections à VNL ne sont pas exclusivement observées chez les personnes atteintes d’une maladie aiguë, bien que ces infections soient généralement considérées comme légères et brèves En ce qui concerne les rotavirus, Richardson et coll. ont signalé que jusqu’à% des enfants hospitalisés excrétaient le virus pendant des périodes prolongées. étude, le rotavirus a été retrouvé chez% des enfants qui ulted un GP & gt; semaines après le début de la maladie Il reste à voir si les profils d’excrétion du VNR sont similaires Autres associations Aucune association n’a été trouvée entre l’infection par G lamblia et les symptômes cliniques Ceci peut être dû au fait que les symptômes spécifiques de G lamblia [Tous les sérotypes d’espèces de Yersinia qui ont été détectés étaient non pathogènes VTEC représente une accumulation de sérotypes avec une pathogénicité différente, et même des sérotypes pathogènes sont connus pour provoquer des infections asymptomatiquesLors de l’interprétation des résultats des analyses des facteurs associés aux infections dues à différents agents pathogènes, nous devons considérer que le groupe de référence dans les analyses était également composé de patients avec gastro-entérite, avec ou sans autre infection. Par conséquent, les facteurs positivement associés à la gastro-entérite négativement associé à une autre infection Étant donné que le comportement de consultation dépendra probablement de l’âge et d’autres facteurs susmentionnés, les résultats de cette étude ne peuvent être extrapolés aux cas de gastroentérite dans la communauté. Comparer les patients de la communauté aux patients qui ont consulté un GP, ​​une étude a été réalisée aux Pays-Bas, et les résultats seront publiés prochainement En conclusion, notre étude des cas de gastro-entérite ayant consulté un médecin généraliste a montré que l’importance des différents pathogènes variait selon les groupes d’âge. nous avons observé une association claire entre les agents d’infection et la durée des symptômes avant que les patients consultent, ce qui était également vrai pour des symptômes spécifiques tels que la fièvre, le sang dans les selles et les vomissements. décision concernant les tests et traitements microbiologiques

Remerciements

Nous remercions tous les médecins généralistes, le NIVEL en particulier le Dr Aad Bartelds, et tous les participants à l’étude pour leur coopération; Hanneke Deijl, Joke Admiraal, Denise Hoek, Nahid Nozari, Petra de Bree, Sandy Altena et Jeroen Meijer, pour avoir effectué les tests de diagnostic; Isabel Araya, pour le soutien administratif; Martien Borgdorff, pour son travail sur la conception et l’initiation de l’étude; et Wilfrid van Pelt, pour ses conseils sur les analyses et la lecture critique du manuscrit